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分子的定義：
分子是通過化學鍵結合在一起的兩個或多個原子的電中性基團。 分子與離子的區別在于它們不帶電荷。 在量子物理學、有機化學和生物化學中，與離子的區別被去掉了，當提到多原子離子時，通常使用分子。
由于分子中原子之間的相互作用，分子的物理和化學性質不僅取決于組成原子的類型和數量，還取決于分子的結構。
 

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分子的物理化學術語：

分子是物質中能夠獨立存在并相對穩定并保持物質物理化學性質的最小單位。
分子是由原子組成的，原子通過一定的力按一定的順序和排列組合成分子。以水分子為例，水不斷分離，直到水的性質不被破壞。
此時出現的最小單位是由兩個氫原子和一個氧原子組成的水分子（H2O）。一個水分子可以通過電解或其他方法細分為兩個氫原子和一個氧原子，但其特性與水完全不同。
有些分子只由一個原子組成，稱為單原子分子，如氦氣和氬氣。這種單原子分子既是原子又是分子。

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由兩個原子組成的分子稱為雙原子分子，如氧分子（O2）和一氧化碳分子（CO）：氧分子由兩個氧原子組成，是同核雙原子分子； 一氧化碳分子由一個氧原子組成，一個碳原子構成一個異核雙原子分子。
由兩個以上原子組成的分子統稱為多原子分子。 一個分子中的原子數可以是幾個、十幾個、幾十個，甚至幾萬個。 例如，一個二氧化碳分子 (CO2) 由一個碳原子和兩個氧原子組成。
一個苯分子含有六個碳原子和六個氫原子（C6H6），有些分子含有數百個原子，如賴脯胰島素，分子式為C257 H383 N65O77 S6。

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分子結構

分子結構或分子三維結構，分子，分子幾何，基于光譜學。
上面的數據，用來描述分子中原子的三維排列。分子結構極大地影響化學物質的反應性、極性、相形、顏色、磁性和生物活性。
分子結構最好在接近絕對零的溫度下測量，因為隨著溫度的升高，分子旋轉也會增加。量子力學和半實驗分子模擬計算可以推導出分子形狀。

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固體分子

固體分子的結構也可以通過 X 射線晶體學來確定。較大的分子通常以多種穩定的構象存在，這些構象之間在勢能平面上的能壘較高。
分子結構與原子在空間中的位置有關，與所要鍵合的化學鍵的類型有關，包括鍵長、鍵角和三個相鄰鍵之間的二面角。
分子中原子的鍵合情況和空間排列：分子結構與物質的物理化學性質有著決定性的關系。最簡單的分子是氫分子。
1克氫含有超過1023個氫分子。水分子中的兩個氫原子與一個中心氧原子相連，鍵角為105.3°。原子在分子中的空隙。

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分子結構理論

由于沒有真正適用的分子結構理論，復雜分子的詳細結構無法預測，只能通過實驗測量。
量子力學認為，原子中的軌道電子具有波動性，通過數學處理電子駐波（原子軌道）可以確定原子或原子團之間鍵的形成。
原子中的電子軌道在空間中重疊的越多，形成的鍵就越穩定。量子力學方法是基于實驗數據和近似數學運算（由高速電子計算機計算）的結合，對于簡單系統來說是準確的，例如對水分子形狀的預測。
另一種理論是把分子看成一個靜電平衡系統：電子和原子核的引力往往最大，電子之間的排斥力往往最小，每個原子核和相鄰原子中電子的引力也很大。重要的。
為了盡量減少對負電荷中心的排斥，系統盡可能對稱排列，所以當系統有2個電子對時，它們呈直線排列（180°），當3個電子對排列成三角形平面時，鍵角 120°。

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分子鍵合

分子鍵分為三種極端類型，即離子鍵、共價鍵和金屬鍵。兩個原子之間的鍵稱為定域鍵。由多個原子共享電子形成的多中心鍵稱為離域鍵。
此外，還有過渡型鍵：鍵電子偏向一側的共價鍵稱為極性鍵，一方提供的鍵形成鍵電子的鍵稱為配位鍵。
通過這些類型的鍵，原子以一定的空間排列組合成分子，形成分子構型和構象。例如，碳是共享電子對鍵（共價鍵）的基本參與者。碳和氫這兩種元素的原子可以形成碳氫化合物。
四面體結構中的CH4是其中最簡單的碳氫化合物，也可以形成環狀化合物，如環己烷、硅和氧是礦物的基本元素，云母和石英中含有硅氧單元。金屬原子夾在烴環平面之間，形成夾層化合物。
蛋白質的堿性成分是一種雙功能分子α-氨基酸，一端有一個堿性基團，一端有一個酸性基團。 化學成分和分子量相同但分子結構不同的物質稱為異構體。
當兩種異構體其他性質相同，但旋光方向相反時，這種異構體稱為旋光異構體。 可用X射線和其他衍射方法、各種光譜、光譜、能譜和質譜來確定或推測分子結構。

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1、分子之間有間隙。例如：取50毫升酒精和50毫升水，混合后體積小于100毫升。
2、構成物質的所有分子都在不停地做著不規則的運動。溫度越高，分子擴散越快，氣體在固體、液體和氣體中的擴散也最快。由于分子的運動與溫度有關，這種運動稱為分子的熱運動。
例如，衣服在炎熱的天氣里很容易干
3、分子直徑的一般量級為10^-10m。
4、分子很小，但有一定的體積和質量。
5、同一種物質的分子性質相同，不同物質的分子性質不同。
 

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化學式：

為了反映分子中各種原子的真實數量，需要使用化學公式。例如，乙烯和丙烯的化學式分別是C2H4和C3H6。
但相同的化學式并不意味著兩個分子是同一種物質，因為分子中原子的排列組合，即分子的結構，也是決定分子性質的因素。
具有相同原子但排列不同的分子稱為異構體。異構體具有相同的化學式，但由于結構關系的不同而具有不同的特性。立體異構體是特殊的異構體，它們可以具有非常相似的物理和化學性質，但同時具有非常不同的生化性質。
通過量子力學定律的計算，分子有一個固定的平衡幾何狀態——鍵的長度和它們之間的夾角。純物質是由具有相同幾何結構的分子組成的。分子的化學式和結構是決定其特性，尤其是化學活性的兩個因素。